Ubuntu环境下安装doris及相关软件教程的方法及命令

安装doris这类的开源专业软件，在linux接下来还算简单，但第一条是认真阅读doris主页上的说明，大部分软件包都有一些先置条件。在debian和Ubuntu由于apt的管理，先置软件包的安装非常方便。
接下来一步步讲解如何在ubuntu下安装doris及相关软件，安装环境是ubutu11.04 amd64 。

0）安装之前gcc，g++，make这些软件应该都安装好了，不确定的话就运行接下来一条命令。

代码:
$ sudo apt-get install gcc g++ make

1）下载doris和fftw包，都放在自己的主目录接下来，比较好操作。

我下载的是doris_v4.02.tar.gz和fftw-3.3.tar.gz。

软件fftw-3.3.tar.gz和fftw-3.3.tar.gz下载。

2）先解压doris，然后在doris目录里面解压fftw，让fftw目录在doris目录里面。由于doris4.02需要fftw-3.2.1，还需要把fftw改一下名字。以下是操作命令。

代码:
$tar xzfv doris_v4.02.tar.gz
//自动生成了doris_v4.02目录，文件在doris_v4.02目录里面
$cd doris_v4.02
$ cp ../fftw-3.3.tar.gz .
//把下载在上一层目录里面的fftw-3.3.tar.gz文件拷贝到当前目录接下来
$tar xzfv fftw-3.3.tar.gz
//解压
$ mv fftw-3.3/ fftw-3.2.1/
//目录改名

3）编译、安装fftw库及doris

代码:
$ cd fftw-3.2.1/

$ ./configure --prefix=`pwd` --enable-float

注意，--prefix=`pwd`中的斜撇是键盘上数字1边上的斜撇。

这一步configure选项可以进一步优化。大家现在的机器都支持sse，cpu都是多核心的，可以加上--enable-sse 和 --with-combined-threads选项，也就是接下来的Linux命令

$./configure --prefix=`pwd` --enable-float --enable-sse --with-combined-threads

//特别的，一旦是32位linux系统，用的是amd的cpu，可以加上 --enable-k7
 
$ make
$ make install
//编译安装，注意--prefix=`pwd`选项保证了fftw库直接安装在pwd，也就是当前的 fftw-3.2.1目录，doris编译时会直接找到自己目录下的fftw。

接下来编译安装doris。作者要求大家在tcsh环境下编译doris，我试过直接在bash接下来编译也没有问题，这里还是按照作者要求在tcsh里面完成。所以，安装doris前安装一个tcsh。
代码:
$sudo apt-get install tcsh
$cd ..
//回到doris目录

$tcsh

$ cd src

//进入到doris接下来的src目录

$ ./configure

//回答应该是一路回车，g++，fftw的lib，include等三个问题是关键，都可以自动完成，一旦有异常，请检查前面。其他的回车就可以。
$ make
$ sudo make install

//最后一步安装doris到/usr/local/bin需要root权限

$ exit

//安装完成后退出 tcsh

这样就安装好了doris。

4）接下来是一些应用，SARtools和ENVISAT_TOOLS 。源代码都在doris目录里面

SARtools很简单的三步
代码:

$cd doris_v4.02/SARtools
$make
$sudo  make install

我用的是64位ubuntu，ENVISAT_TOOLS 需要先安装 libc-dev-i386
代码:
$sudo apt-get install  libc6-dev-i386

然后make和sudo make install

代码:

$ cd doris_v4.02/ENVISAT_TOOLS

$ make
$sudo make install

5）接下来是getorb，snaphu，GMT

doris主页download页面（http://doris.tudelft.nl/Doris_download.html）有getorb和snaphu的相关链接

snaphu与getorb软件下载getorb_2.3.2.tar.gz和snaphu-v1.4.2.tar.gz。

解压下载的软件，进入解压这个文件包之后的目录，命令就不重复给了，直接给出安装要点。
getorb需要使用fortran进行编译，先安装一个fortran包
代码:
$ sudo apt-get install gfortran
$ vi Makefile
//修改Makefile 找到 FC = gfortran 行，删除前面的#号（vi操作：光标移到#，按x，esc，冒号，wq保存退出。）
然后make 和 sudo make install

snaphu在安装man文件的时候会出现小问题。解决办法，安装之前先建一个目录：
代码:
$ sudo mkdir /usr/local/man/man1
然后很简单，进入src目录，make 和 sudo make install。

GMT包可以直接用apt-get安装，
代码:
$ sudo apt-get install gmt

6）以上软件的执行文件都安装在 /usr/local/bin接下来，到该目录里面去检查一下，发现有几个文件没有执行权限，增加执行权限即可。

代码:
$  cd  /usr/local/bin
$ sudo chmod 755 *.*
$ sudo chmod 755 *

7）tsx影像的读取问题，需要安装gdal，python，libxml2，python-lxml，libxslt1等软件包，直接用apt-get命令解决。

代码:
$ sudo apt-get install gdal-bin libxslt1.1 python-lxml python libxml2

8）安装 matlab2010a
下载matlab2010a for linux，原始文件名为[矩阵实验室].Mathworks.Matlab.R2010a.UNIX.ISO-TBE.iso matlab.iso
先把iso文件改个名字：
代码:
$ mv  [矩阵实验室].Mathworks.Matlab.R2010a.UNIX.ISO-TBE.iso matlab.iso

挂载iso
代码:
$ sudo mount -t iso9660 -o ro,loop=/dev/loop0 相关路径/matlab.iso /mnt

安装matlab之前解决libc.so.6找不到的问题
代码:
$ sudo ln -s /lib64/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 /lib/libc.so.6

再进入相关目录，运行安装程序
代码:
$ cd /mnt
$  ./install

安装好之后还有一个建立执行链接的问题：

1）一旦安装在/usr之类的目录下，桌面上右键，创建启动器，命令中填入 gksudo 'Matlab安装目录/bin/matlab -desktop' 即可；

2）一旦安装在自己的登录目录，桌面上右键，创建启动器，命令中填入  Matlab安装目录/bin/matlab -desktop' 即可；

另外还有中文字体的问题，直接在matlab里面file—perferences—fonts设置中文字体即可。

9）stamps的安装，下载StaMPS_v3.2.1.tar.gz 。
代码:

$tar xfzv StaMPS_v3.2.1.tar.gz

进入StaMPS_v3.2.1

$ cd StaMPS_v3.2.1
$ make
$ sudo make install

这样就全部完成了。

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